Ok, ho capito che non sono stati abbinati tutti i files con le applicazioni di default. Sto ricostruendo tutto anche per le estensioni .rtf, .docx, .xls, . mht, etc... Lavoro lungo ma funzionante. Buona anche l'idea di firefox come lettore pdf.
Se ti vengono in mente altre estensioni note da verificare procedo a correggerle. Certo, LibreOffice si dimostra molto valido come impostazione di default per molte applicazioni. Dopo l'eliminazione di Zathura ed Evince, elimino anche Gnumeric che crea problemi e alleggerisco l'iso.
Ho ormai installato in 3 pc ma non avverto il problema della tray....
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EDIT:
ho ricostruito l'iso e lo invio per domani. Ho applicato tutte le modifiche. Ma quando parli di problemi alla tray ti riferisci a quella sopra o sotto?